Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PLNP26678 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms