Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMA3P25788 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms