Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRZ1P23471 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRZ1P23471 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms