Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD247P20963 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD247P20963 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms