Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LIG1P18858 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIG1P18858 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIG1P18858 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIG1P18858 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIG1P18858 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIG1P18858 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIG1P18858 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIG1P18858 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIG1P18858 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIG1P18858 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIG1P18858 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIG1P18858 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIG1P18858 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LIG1P18858 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LIG1P18858 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LIG1P18858 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms