Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LBPP18428 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LBPP18428 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LBPP18428 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LBPP18428 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LBPP18428 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LBPP18428 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LBPP18428 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LBPP18428 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LBPP18428 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LBPP18428 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LBPP18428 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LBPP18428 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LBPP18428 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LBPP18428 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms