Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB1P16220 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB1P16220 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CREB1P16220 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CREB1P16220 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms