Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ITGB4P16144 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ITGB4P16144 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms