Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TNP1P09430 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TNP1P09430 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TNP1P09430 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TNP1P09430 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TNP1P09430 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TNP1P09430 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TNP1P09430 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 NRAP-201ENST00000359988 5580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
TNP1P09430 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms