Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APODP05090 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APODP05090 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APODP05090 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APODP05090 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APODP05090 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APODP05090 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms