Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDB2O43679 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDB2O43679 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDB2O43679 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDB2O43679 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDB2O43679 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDB2O43679 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDB2O43679 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDB2O43679 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDB2O43679 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDB2O43679 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDB2O43679 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDB2O43679 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDB2O43679 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDB2O43679 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDB2O43679 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LDB2O43679 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LDB2O43679 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LDB2O43679 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LDB2O43679 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LDB2O43679 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LDB2O43679 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LDB2O43679 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LDB2O43679 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LDB2O43679 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LDB2O43679 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LDB2O43679 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDB2O43679 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDB2O43679 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDB2O43679 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDB2O43679 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDB2O43679 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDB2O43679 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDB2O43679 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LDB2O43679 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms