Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 TMEM126A-201ENST00000304511 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 LINC02407-202ENST00000553247 1083 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNPHO15079 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SNPHO15079 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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SNPHO15079 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNPHO15079 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNPHO15079 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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