Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KDM6BO15054 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms