Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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USP17L12C9JPN9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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USP17L12C9JPN9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP17L12C9JPN9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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