Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms