Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C4orf47A7E2U8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms