Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME2A4GXA9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms