Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
E2F8A0AVK6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
E2F8A0AVK6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms