Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
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