Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms