Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP1Q9Y3L3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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SH3BP1Q9Y3L3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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SH3BP1Q9Y3L3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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SH3BP1Q9Y3L3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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SH3BP1Q9Y3L3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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SH3BP1Q9Y3L3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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