Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms