Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
C6orf48Q9UBA6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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