Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC180Q9P1Z9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC180Q9P1Z9 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms