Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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