Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms