Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTLNQ9NXG0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTLNQ9NXG0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms