Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJC28Q9NX36 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms