Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TBCCD1Q9NVR7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms