Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMBRD1Q9NUN5 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms