Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms