Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HMG20AQ9NP66 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HMG20AQ9NP66 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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