Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC24A3Q9HC58 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms