Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4CQ9C0C4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms