Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NUP58Q9BVL2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NUP58Q9BVL2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms