Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYT17Q9BSW7 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms