Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM29Q9BSF4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms