Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LPIN3Q9BQK8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LPIN3Q9BQK8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms