Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPAS2Q99743 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms