Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC7Q96M83 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC7Q96M83 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms