Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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