Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C18orf8Q96DM3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms