Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms