Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms