Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOPBP1Q92547 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms