Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMPDL3AQ92484 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms