Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NEDD1Q8NHV4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NEDD1Q8NHV4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms