Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTC21AQ8NDW8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTC21AQ8NDW8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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