Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ZNF439Q8NDP4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ZNF439Q8NDP4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ZNF439Q8NDP4 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ZNF439Q8NDP4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ZNF439Q8NDP4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ZNF439Q8NDP4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ZNF439Q8NDP4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF439Q8NDP4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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