Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM71DQ8N9W8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms